Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms