Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SpopQ6ZWS8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms