Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Kcnt1Q6ZPR4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Kcnt1Q6ZPR4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Kcnt1Q6ZPR4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Kcnt1Q6ZPR4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Kcnt1Q6ZPR4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Kcnt1Q6ZPR4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnt1Q6ZPR4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Kcnt1Q6ZPR4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Kcnt1Q6ZPR4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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