Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b3Q6UQ17 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms