Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms