Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

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Length 452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt42Q6IFX2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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