Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6DFW0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms