Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PatjQ63ZW7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PatjQ63ZW7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PatjQ63ZW7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PatjQ63ZW7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PatjQ63ZW7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PatjQ63ZW7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PatjQ63ZW7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PatjQ63ZW7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PatjQ63ZW7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PatjQ63ZW7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PatjQ63ZW7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PatjQ63ZW7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PatjQ63ZW7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PatjQ63ZW7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PatjQ63ZW7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PatjQ63ZW7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PatjQ63ZW7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PatjQ63ZW7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PatjQ63ZW7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PatjQ63ZW7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PatjQ63ZW7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PatjQ63ZW7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PatjQ63ZW7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PatjQ63ZW7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PatjQ63ZW7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PatjQ63ZW7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms