Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms