Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms