Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms