Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms