Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EsrrbQ61539 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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