Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms