Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdh12Q5RJH3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms