Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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