Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp235Q499D5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms