Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms