Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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Prdm6Q3UZD5 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Prdm6Q3UZD5 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms