Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUL7

Dcaf17, DDB1- and CUL4-associated factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf17Q3TUL7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dcaf17Q3TUL7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms