Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms