Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ccbe1Q3MI99 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ccbe1Q3MI99 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ccbe1Q3MI99 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ccbe1Q3MI99 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ccbe1Q3MI99 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ccbe1Q3MI99 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ccbe1Q3MI99 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccbe1Q3MI99 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ccbe1Q3MI99 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Ccbe1Q3MI99 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccbe1Q3MI99 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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