Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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