Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl9Q32KG4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl9Q32KG4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl9Q32KG4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl9Q32KG4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl9Q32KG4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl9Q32KG4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtl9Q32KG4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtl9Q32KG4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtl9Q32KG4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtl9Q32KG4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtl9Q32KG4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtl9Q32KG4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtl9Q32KG4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtl9Q32KG4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtl9Q32KG4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtl9Q32KG4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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