Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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