Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms