Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms