Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms