Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox13Q04891 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms