Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms