Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col1a2Q01149 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms