Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54lP70270 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54lP70270 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rad54lP70270 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54lP70270 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54lP70270 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54lP70270 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54lP70270 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54lP70270 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rad54lP70270 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54lP70270 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54lP70270 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54lP70270 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54lP70270 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54lP70270 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54lP70270 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54lP70270 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54lP70270 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54lP70270 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54lP70270 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54lP70270 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54lP70270 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54lP70270 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54lP70270 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54lP70270 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54lP70270 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54lP70270 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54lP70270 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54lP70270 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54lP70270 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54lP70270 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54lP70270 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rad54lP70270 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rad54lP70270 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54lP70270 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54lP70270 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54lP70270 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54lP70270 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rad54lP70270 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54lP70270 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54lP70270 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54lP70270 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54lP70270 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rad54lP70270 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54lP70270 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rad54lP70270 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Rad54lP70270 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad54lP70270 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad54lP70270 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad54lP70270 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad54lP70270 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad54lP70270 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rad54lP70270 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms