Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf5P70191 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf5P70191 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf5P70191 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf5P70191 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf5P70191 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms