Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CgnP59242 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CgnP59242 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CgnP59242 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CgnP59242 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CgnP59242 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CgnP59242 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CgnP59242 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CgnP59242 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CgnP59242 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CgnP59242 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CgnP59242 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CgnP59242 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CgnP59242 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CgnP59242 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CgnP59242 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CgnP59242 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CgnP59242 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CgnP59242 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CgnP59242 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CgnP59242 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CgnP59242 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CgnP59242 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CgnP59242 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CgnP59242 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CgnP59242 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CgnP59242 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CgnP59242 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CgnP59242 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CgnP59242 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CgnP59242 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CgnP59242 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CgnP59242 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CgnP59242 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CgnP59242 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CgnP59242 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CgnP59242 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CgnP59242 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CgnP59242 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CgnP59242 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CgnP59242 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CgnP59242 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CgnP59242 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CgnP59242 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CgnP59242 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CgnP59242 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CgnP59242 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CgnP59242 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CgnP59242 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CgnP59242 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CgnP59242 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CgnP59242 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CgnP59242 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CgnP59242 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CgnP59242 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CgnP59242 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CgnP59242 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CgnP59242 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CgnP59242 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CgnP59242 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CgnP59242 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CgnP59242 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CgnP59242 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CgnP59242 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CgnP59242 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CgnP59242 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CgnP59242 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CgnP59242 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CgnP59242 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CgnP59242 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CgnP59242 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CgnP59242 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CgnP59242 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CgnP59242 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CgnP59242 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CgnP59242 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CgnP59242 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CgnP59242 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CgnP59242 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CgnP59242 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CgnP59242 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CgnP59242 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CgnP59242 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CgnP59242 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CgnP59242 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CgnP59242 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CgnP59242 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CgnP59242 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CgnP59242 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CgnP59242 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CgnP59242 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CgnP59242 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CgnP59242 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CgnP59242 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CgnP59242 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CgnP59242 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CgnP59242 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CgnP59242 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CgnP59242 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CgnP59242 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms