Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csrnp3P59055 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms