Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms