Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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