Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Psen1P49769 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psen1P49769 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psen1P49769 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms