Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VdrP48281 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VdrP48281 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VdrP48281 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VdrP48281 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VdrP48281 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VdrP48281 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VdrP48281 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VdrP48281 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VdrP48281 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VdrP48281 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VdrP48281 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VdrP48281 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VdrP48281 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VdrP48281 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VdrP48281 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VdrP48281 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VdrP48281 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VdrP48281 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VdrP48281 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VdrP48281 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VdrP48281 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VdrP48281 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VdrP48281 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VdrP48281 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VdrP48281 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VdrP48281 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VdrP48281 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VdrP48281 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VdrP48281 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VdrP48281 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VdrP48281 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VdrP48281 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VdrP48281 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VdrP48281 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VdrP48281 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VdrP48281 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VdrP48281 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VdrP48281 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VdrP48281 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VdrP48281 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VdrP48281 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VdrP48281 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VdrP48281 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VdrP48281 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VdrP48281 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VdrP48281 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VdrP48281 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VdrP48281 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VdrP48281 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VdrP48281 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VdrP48281 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VdrP48281 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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VdrP48281 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VdrP48281 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VdrP48281 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VdrP48281 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VdrP48281 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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VdrP48281 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VdrP48281 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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VdrP48281 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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VdrP48281 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VdrP48281 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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VdrP48281 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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VdrP48281 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VdrP48281 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VdrP48281 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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VdrP48281 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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VdrP48281 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VdrP48281 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VdrP48281 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VdrP48281 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VdrP48281 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VdrP48281 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VdrP48281 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VdrP48281 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VdrP48281 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VdrP48281 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VdrP48281 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VdrP48281 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VdrP48281 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VdrP48281 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VdrP48281 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VdrP48281 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VdrP48281 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VdrP48281 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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