Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtgfrP43117 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms