Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Mmp9P41245 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Mmp9P41245 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Mmp9P41245 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Mmp9P41245 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Mmp9P41245 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Mmp9P41245 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Mmp9P41245 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Mmp9P41245 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Mmp9P41245 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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