Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
THBS4P35443 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
THBS4P35443 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
THBS4P35443 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms