Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Usp4P35123 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Usp4P35123 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Usp4P35123 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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