Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Hoxc10P31257 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Hoxc10P31257 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Hoxc10P31257 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Hoxc10P31257 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms