Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TP20293 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TP20293 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TP20293 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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