Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms