Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms