Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sdc1P18828 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms