Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pou4f1P17208 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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