Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calm3P0DP28 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calm3P0DP28 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calm3P0DP28 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calm3P0DP28 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calm3P0DP28 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calm3P0DP28 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calm3P0DP28 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calm3P0DP28 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calm3P0DP28 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms